诊断标准须符合如下条件：存在两种易性标志(渴望或坚称自己为另性别),对自身性别的不适感或对自身性别角色的厌恶感.易性标志绝不仅仅是渴望成为异性从中获得人文益处.例如,个男孩子说他想做女孩,这样他就可以像他的小妹妹样受到特殊照顾,但这并不表示他有性身份障碍.要确诊性身份障碍需要有显著的痛苦或者在社会,职业或其他重要功能领域的明显损害.如果个体仅仅热衷于异性装扮或其他异性活动,而没有反复发作的心理痛苦或功能损害,或者个体在躯体上具有两性症状(如先天性肾上腺增生,生殖器分化不良,雄激素失敏综合征),均不能诊断为性身份障碍.

　　性角色行为遵从系列传统的男性或女性习惯.比起男孩子的娘娘腔,西方文化更能包容年轻女孩的假小子行为(通常并不伴有性身份障碍).许多男孩扮作女孩或母亲的角色,包括穿戴姐妹或母亲的衣服.这种行为通常是正常发育过程中的个阶段.这种行为和伴随的希望表达只有在极端情况下才会成为异性偏执.这时才应考虑诊断为儿童性身份障碍.